Η ακαδημία κολύμβησης του Παναθηναϊκού αποτελεί έναν εξαιρετικό θεσμό εκπαίδευσης, προσφέροντας στους νέους κολυμβητές εξειδικευμένη καθοδήγηση και υψηλό επίπεδο επαγγελματισμού.

Με αφοσίωση στην τεχνική, την ανάπτυξη φυσικών ικανοτήτων και τη διαμόρφωση του χαρακτήρα, η ακαδημία συμβάλλει στη δημιουργία εξαιρετικών κολυμβητικών και ανθρώπινων προσόντων.

Με τον Παναθηναϊκό ως υποστηρικτή, η ακαδημία παρέχει ένα θετικό και ενθαρρυντικό περιβάλλον για την ανάπτυξη των νέων κολυμβητών, ενισχύοντας την αγάπη τους για το άθλημα και την επίτευξη υψηλών επιδόσεων.

Το τμήμα κολύμβησης του Παναθηναϊκού ιδρύθηκε για πρώτη φορά το 1925.
Το 1950 ξεκίνησε η κατασκευή κολυμβητηρίου στο γήπεδο της Λεωφόρου Αλεξάνδρας ενώ την ίδια χρονιά. Το 1952 ο Παναθηναϊκός κατακτά το πρώτο του Πρωτάθλημα, επιτυχία που επαναλαμβάνει το 1953, το 1954, το 1955, το 1956 , το 1957, που μαζί με το πρωτάθλημα που κατέκτησε το 1958 ισόβαθμος με το Παλαιό Φάληρο, συμπληρώνει τα 7 συνεχόμενα. Μετά από μικρή παύση, ο Παναθηναϊκός επιστρέφει το 1964, το 1965 και το 1966. Το 1968 το Τριφύλλι κατέκτησε το τελευταίο του πρωτάθλημα. Το 2001 ο Παναθηναϊκός τερματίζει 10ος και το 2004 βρίσκεται στη 4η θέση μετά από 20 χρόνια, ενώ το 2005 τερμάτισε 2ος.